הלימודים עוסקים ביצירות המופת של ההגות היהודית לדורותיה ובהשוואה לדפוסי החשיבה של ההגות הכללית, ומקנים היכרות עמוקה עם ההגות היהודית, החל מתקופת בית שני ועד לעת החדשה.
בין הקורסים הנלמדים בתואר: ספרות חיצונית יהודית-הלניסטית, ספרות קומראן, ספרות מיסטית בעת העתיקה, מחשבת חז"ל, פילוסופיה יהודית בימי-הביניים ובתקופת הרנסנס, קבלה בימי-הביניים וברנסנס, פילוסופיה יהודית בעת החדשה, קבלה ומיסטיקה בעת החדשה, פילוסופיה של ההלכה, מחשבה ציונית, מחשבה מדעית, מיתוס ועוד.