מגמת משנה מכטרוניקה, הינה חלק ממגמת מכונות בדגש על מערכות בקרה ואוטומציה במכונות. במהלך הלימודים לומדים הסטודנטים בנוסף ללימודי בסיס במכונות, על מערכות בקרה אינטגרליות למכונה הכוללות רגשים (סנסורים) בקרים מתוכנתים, רובוטיקה, תיכנון ויישום שיטות בקרה במכונות ועוד. בסיום הלימודים, יכולים הסטודנטים להשתלב בתעשיה של תיכנון ובנית קווי יצור מפוקדי בקרים, תחזוקה של מערכות משולבות ועוד.