הנדסה פרמצבטית עוסקת בתהליכי תכנון, ייצור ופיתוח תרופות, משלב המחקר והייצור של הרכיב הפעיל של תרופה, מולקולה כימית או ביולוגית, ועד לתכנון המערכות המותאמות לייצורה של התרופה, ניהול קווי הייצור, בקרת האיכות ועוד.
התואר כולל הכשרה מקיפה בלימודי מדע בסיסיים כמו כימיה, ביוכימיה, מתמטיקה ופיזיקה, וכן קורסים מתקדמים בתחום הנדסה פרמצבטית ביניהם הנדסה גנטית, ביוטכנולוגיה פרמצבטית, אבטחת איכות ורגולציה פרמצבטית, מיקרוביולוגיה וביטוי חלבונים בתאים, אימונולוגיה, יסודות בפרמקולוגיה, יסודות בפרמקוקינטיקה, טכנולוגיה פרמצבטית תעשייתית, פיתוח תרופות ועוד.