מאפשרת השתלבות בתעשייה הכימית בישראל, המהווה את אחת התעשיות המפותחות ביותר במשק. בוגרות ובוגרי המגמה משתלבים בתפקידים מגוונים לרבות בעבודת מעבדה. תפקיד הנדסאי הכימיה כולל עבודת תכנון עצמאית ובצוות, הרצת תהליכי ייצור חדשים ויישום ברמת המפעל ופיקוח על שלבי ייצור. במעבדה התפקיד כולל פיתוח, מחקר וייצור, בבדיקות איכות ואנליזה. למגמה מספר מגמות משנה: כימיה, גרעין וביוטכנולוגיה. הלימודים במגמה מכשירים את הסטודנטים לעסוק במגוון נושאים בתחומי המחקר ובתעשייה הביוטכנולוגית: חברות תרופות, דיאגנוסטיקה ומזון, בתחום החקלאות ושימור הסביבה.